Udover det almindelige kontingent betaler visse medlemskategorier kontingent til Forskningsfonden eller til Aktivitets- og udviklingspuljen.
Midlerne i forskningsfonden anvendes til uddeling af forskningsmidler til fysioterapeuter, som er ordinære medlemmer og har dansk autorisation. Fonden har som formål at yde støtte til forskningsprojekter, der kan bidrage til fagets videnskabelige grundlag, dokumentere effekt af fysioterapi samt udvikle fysioterapipraksis. Forskningsfonden uddeler desuden Danske Fysioterapeuters jubilæumslegat og studielegat.
Midler fra Aktivitets- og udviklingspuljen kan benyttes til særlige udviklingsprojekter og aktiviteter på Danske Fysioterapeuters praksisområde.